Ανήκει στο γένος Neisseriae της οικογένειας Neisseriaceae.
Είναι Gram αρνητικός ωοειδής κόκκος, που διατάσσεται κατά ζεύγη, αερόβιος, δυνητικά αναερόβιος, ακίνητος, με θετική την δοκιμασία της οξειδάσης και της καταλάσης θετικός μικροοργανισμός.
Ο αποικισμός και η φλεγμονή του βλεννογόνου από το γονόκοκκο απαιτούν σίδηρο που είναι απαραίτητος για το μεταβολισμό.
Ο γονόκοκκος έχει τη δυνατότητα γενετικά, να ρυθμίζει ενζυματικές μεθόδους για την απελευθέρωση σιδήρου από τρανσφερίνη και λακτοφερίνη.
Ο γονόκοκκος έχει την δυνατότητα να προσβάλλει τον ενδοτράχηλο, και να εξαπλωθεί στον ανώτερο γεννητικό σωλήνα και να προκαλέσει πυελική φλεγμονή.
Η Ν.gonorrhoeae θεωρείται πάντοτε παθογόνος ανεξαρτήτως του σημείου απομόνωσης και αποτελεί τον αιτιολογικό παράγοντα της γονόρροιας.
Στους άνδρες η N.gonorrhoeae προκαλέι οξεία ουρηθρίτιδα με δυσουρία και ουρηθρικό έκκριμα.
Στις γυναίκες η πρωταρχική εστία φλεγμονής είναι ο ενδοτράχηλος (τραχηλίτιδα).
Ο καλυτερος τρόπος για την απομόνωση του γονοκόκκου από τα δείγματα είναι ο άμεσος ενοφθαλμισμός σε θρεπτικά υλικά μετά τη συλλογή.
