Ο βιοχημικός έλεγχος του σπέρματος αφορά την εξέταση άλλων παραμέτρων του σπέρματος εκτός των σπερματοζωαρίων.
Το σπερματικό υγρό περιέχει μία σειρά ουσιών που εκκρίνονται από τα επικουρικά σεξουαλικά όργανα που περιλαμβάνουν κυρίως τον προστάτη, τις σπερματοδόχες κύστεις και τις επιδιδυμίδες.
Ο βιοχημικός έλεγχος του σπέρματος εξετάζει τα επίπεδα του ψευδαργύρου, της φρουκτόζης και της ουδέτερης γλουκοσιδάσης.
Η εκτίμηση των βιοχημικών παραμέτρων του σπέρματος γίνεται ταυτόχρονα με την εκτίμηση των σπερματοζωαρίων στο εργαστήριο με ειδικές τεχνικές
Ο βιοχημικός έλεγχος είναι απαραίτητος, όταν υπάρχει υποψία απόφραξης της αποχετευτικής οδού του σπέρματος ή αγενεσίας, δυσλειτουργία των επικουρικών αδένων, παρουσία λοιμώξεων κατώτερου ουροποιηικού, υπογονιμότητα.
Για τη σωστή λήψη δείγματος απαιτείται αποχή από εκσπερμάτιση 2-7 ημέρες.